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Canoco 5免費版(生態學數據處理軟件) v5.02 電腦版

Canoco 5免費版最新版下載評分:3.0
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Canoco 5最新版

Canoco 5免費版軟件功能

主要響應曲線(PRC)的計算,測試和繪圖現在是一項簡單的任務。

可以使用協同對應分析(CoCA,對稱形式),包括兩種比較社區類型之間協變的蒙特卡羅排列測試。

預測器的逐步選擇在視覺上得到增強,現在提供對I型錯誤膨脹的保護支持(所有預測器的初步測試和通過三種方法之一調整p值:錯誤發現率(FDR)估計,Holm校正和Bonferroni)更正。

可以直接測試所有約束軸,並將兩個坐標的結果與Procrustes分析進行比較。

您可以輕鬆處理物種功能特征或導入物種的係統發育相關性數據,以及計算和使用功能多樣性。

可視化功能通過半透明填充顏色,在排列圖中顯示可變'箭頭的校準軸,或繪製封閉橢圓作為封閉多邊形的替代方案等功能得到增強。其他類型的JPEG,TIFF和PDF文件格式的導出已添加到現有(PNG,BMP,EMF,Adobe Illustrator)。

您的工作的每一步都由上下文相關的幫助係統和Canoco Adviser支持 - Canoco Adviser是一個專家係統,可幫助您為研究問題選擇合適的分析方法,糾正排序模型的類型(線性與單峰),數據轉換,或結果的適當可視化。它甚至建議您如何解釋您在圖形向導的幫助下創建的排序圖。

高級用戶可以在一次分析中組合多種方法,包括廣義線性模型以關聯分數等。

分析和繪圖功能與易於使用的電子表格數據編輯器集成在一個程序中。現在,在Canoco 5項目中收集了對一組數據表進行的所有分析,共享分析和繪圖設置。

Canoco for Windows 4.5提供的所有統計方法都可用,例如DCA,CA,CCA,DCCA,PCA和RDA方法 - 包括它們的部分變體,使用受約束排序方法的蒙特卡羅排列測試,為即將到來的數據提供適當的排列設置來自非平凡的抽樣設計。

CanoDraw 4.x提供的所有可視化工具都可用(包括用於可視化排序空間中數據屬性的黃土,GLM和GAM模型),其中許多都得到了改進。

數據可以在程序中輸入,也可以從Excel(.XLS或.XLSX格式)或Canoco 4.x數據文件輕鬆導入。標簽不再需要縮短為8個字符,但這些簡短形式仍可在排序圖中顯示,甚至可以從長標簽中自動生成。現在使用標準的因子編碼(分類預測器),在內部生成虛擬(0/1)變量。編輯器允許從虛擬變量轉換為因子,如果需要,則反轉。

現在可以輕鬆訪問主坐標分析(PCoA)和基於距離的RDA(db-RDA),增加了新的距離測量(總共11種距離類型,包括Bray-Curtis,Gower距離或Jaccard係數)。類似地,還支持非度量多維縮放(nMDS)。

對於兩組或三組預測變量,可以輕鬆訪問變異分區,包括根據部分或非部分分析計算所解釋變量的各個分數,並使用原始或調整後的變異估計。

鄰域矩陣的主坐標(PCNM)方法在變體分區框架內可用。當前實現與Legendre&Legendre(2012)中描述的建議匹配替代方法名稱(dbMEM)。

Canoco 5免費版使用教程

如何顯示排序分數值?

在Canoco 5分析中,仍然可以從解決方案(.SOL)文件中獲得CANOCO 4.x版本中的排序分數和其他排序統計數據,但通常不會顯示它們。當您在特定用戶帳戶上開始使用Canoco 5時,分析筆記本將以簡短模式顯示,僅顯示摘要頁麵和已創建的圖表,其他信息(排序分數和分析日誌)將被隱藏。要以非簡短模式顯示分析筆記本,您必須選擇編輯| 設置| Canoco5選項命令從主菜單和Canoco選項對話框的常規頁麵中取消選中“顯示帶分析結果的筆記本的簡短版本”框:

然後用OK按鈕關閉對話框。

請注意,在更改選項後,已顯示的筆記本不會更改其內容。您必須關閉筆記本(例如,使用分析列表下方的“ 隱藏”按鈕),然後再次重新打開它(例如,使用“ 顯示”按鈕替換“ 隱藏”按鈕,以便使用已關閉的筆記本進行分析)。隱藏和重新顯示分析筆記本時,您應該注意,如果定義了多個分析並且隱藏了分析筆記本,則焦點通常會切換到另一個分析。因此,要重新打開原始分析的分析筆記本,必須在分析列表中重新選擇它。

得分頁麵中顯示的分數可以複製到剪貼板,並在Canoco 5程序內部或外部進一步重複使用。有兩個用於複製所選分數列的上下文菜單命令:複製分數複製表格內容,如分數頁麵中所示,而擴展複製將行集與對應的數據項集(案例,響應變量等)對齊。項目:當您想要將計算得分作為新數據表複製到項目中時,這很重要(分析輸出中可能缺少某些數據項,另一方麵,因子變量會生成多組得分)。

如何從分析中省略案例或響應變量?

當您開始在特定用戶帳戶上使用Canoco 5時,Analysis Setup Wizard將以所謂的QuickWizard模式顯示。這反映在QuickWizard按鈕(由以下快照中的紅色矩形強調)中顯示為處於按下狀態。

無論何時想要省略(或加權)個案或響應變量,在創建新分析(例如,單擊分析列表下方的“ 新建”按鈕)之前,必須通過單擊此按鈕(其外觀變為平坦)來關閉QuickWizard模式。 )或在更改現有分析的選項之前(例如,通過單擊“ 修改”按鈕,然後在現有分析中選擇“ 替換”)。

關閉QuickWizard模式後,Analysis Setup Wizard會顯示更多頁麵,包括Response和Explanatory Data頁麵:

如果您檢查(如上麵的快照中)標有“選擇”的一個或兩個框...,安裝向導將稍後顯示相應的頁麵,其中可以選擇案例和/或響應變量的子集進行分析。

要再次打開QuickWizard模式,請單擊工具欄中的相同按鈕(它是一個切換按鈕)。

您可以使用Project |定義案例組和變量組 團體| ...菜單命令然後使用設置向導的相應項目選擇頁麵上的“ 從”組按鈕選擇或省略屬於特定組的個案或變量。

Canoco 5免費版常見問題

Canoco 5可以在Linux或MacOS上運行嗎?

Canoco 5沒有針對這些操作係統的本機實現,但Canoco 5經過測試,可在Linux上的Wine環境下運行,同樣在CrossOver包的類似環境中運行。以下快照說明了如何在Ubuntu Linux工作區中使用雙時隙圖。

Canoco 5是64位程序嗎?

現在Canoco 5軟件包中隻有一個應用程序,安裝程序在64位Windows上安裝64位版本,在32位Windows上安裝32位版本。讀取和存儲的文件在32位和64位版本的Canoco 5之間兼容。

Canoco如何處理Oksanen&Minchin(1997)報告的穩定性問題?

最初的DECORANA(Hill,1979)Detrended Correspondence Analysis代碼中的錯誤已在15年前的Canoco 4版本之前進行了研究和修複。事實證明,Oksanen和Minchin(1997)提出的改變並沒有使平滑常規順序不變。根據Oksanen&Minchin在隨後的通信中達成的協議還需要進行另一項更改 。

Canoco 5能提供NMDS嗎?

是的,非度量多維縮放(NMDS或NMS)方法現已完全集成到Canoco 5中,取代了以前版本的附加程序WinKyst。WinKyst程序仍然可用作執行NMDS分析的免費替代解決方案。

是否可以為舊版本的用戶升級?

是的,您可以從舊版本的Canoco升級。請聯係您購買原始Canoco版本的經銷商,以獲得有關可用性和定價的更準確信息(Scientia客戶,請參閱問題10)。

Canoco 5可以在Windows 8/10和其他Windows平台上運行嗎?

在Canoco 5發布時,Canoco可以在32位和64位版本的Windows 8,8.1或10的標準台式機和筆記本電腦上正常工作。Window 8.x和10還支持其他平台,例如用手指觸摸屏幕管理的小型移動設備,但是,正如任何程序分析和可視化科學數據一樣,Canoco 5也不會擅長。

Canoco 5也適用於其他Microsoft操作係統,從安裝了SP(service pack)2或SP3的Microsoft Windows XP開始。這還包括Windows Vista和Windows 7。

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