當戰爭來臨的時候，你該如何去抉擇呢？德軍總部2新巨人遊戲裏的故事是曼哈頓的反抗軍們加入了B.J的隊伍，葛蕾絲在知道伊娃之錘F區有核彈後，希望B.J再去F區給她找來核彈。那麼，德軍總部2新巨人第三章古老的秘密怎麼玩呢？讓我們拭目以待！
沿著水管進入F區，此時的F區大部分地區已經被水淹沒，需要遊泳過去，注意水下缺氧是會直接掉血的，不要在水下呆的時間過長。沿地圖走很快會看到風扇裝置，關閉後，下水穿過風扇上岸，接著上樓梯來到間有許多動力爐的房間，清掉裏麵的偵察機，繼續前進。
這裏的路基本都是直線，按地圖走即可。
在通風管道盡頭跳下來到電力室，打開電源後會有出現3個納粹機甲兵提前準備好鐳射槍擊殺。接著從兩邊的口子跳下。
注意這層也有2個機甲兵但不會第一時間出現小心被陰。解決後，沿著地圖上方的鐵管可以進入控製室打開大門。出門後爬上扶梯，來到核彈房外。這裏有2架偵察機及1個機甲兵擊殺後來到2層打開核彈房門。核彈房門打開後會有3個機甲兵支援，準備好鐳射槍擊殺。房間能有充能裝置如果電能不夠充能完後再開門。
